En la EAI, la educación ambiental es una cuestión fundamental para la formación integral de las personas. Dentro de la escuela alumnos y personal separan la basura, las hojas blancas y de libretas se usan por los dos lados, y en cada salón y oficina las hojas se separan para reusar y reciclar.

Además una vez al mes, diferentes grupos de primaria mayor y secundaria realizan el Operativo de Acopio, en el que participa toda la comunidad Activa trayendo residuos y material de reciclado que separaron en casa, con el objetivo de formar personas responsables de su entorno mediante la separación de residuos y reciclaje en casa y el consumo responsable.